其过程之艰辛，自不必多说，那是没有亲身经历过的人难以想象的。
其中最后一个能与帝国分庭抗礼的势力联盟被吞并，也花费了整整三十年之久的岁月，期间死伤无数，宇宙人总人口锐减到了原先的三分之一。最后联盟溃败，他们的版图成为了帝国的一部分，但是联盟的某位将领不愿意投降，逃逸到偏远星系成立了自由军政府。
当然，在帝国这里他们不叫这个名字，官方叫法是叛军。
战争的结束无异于一场涅槃，这股叛军势力在帝国休养生息，或是迎战虫族的间隙里，亦得到喘息的时间，因此得以在夹缝中生存下来，竟是与帝国的寿命同样长久，甚至还偶有壮大的时候，吸纳了许多反帝国人士，还有海盗，逃犯，慢慢形成了一定规模，虽然不足以对帝国形成致命的威胁，却是一个巨大的隐患。
提升二次进化的药物被开发出来，既然能激发人的潜质，直接点说就是提高战斗能力，所以在管控上是非常严格的，为的就是杜绝流入叛军手里，但是黑市上只要开出价钱，总有人铤而走险。
而楼韵泽这个真正的药
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